Het is aan te raden om de licentiehouder te laten aantekenen in het Benelux merkenregister. Alleen dan kan een licentiehouder rechtstreeks een schadevergoeding of winstafdracht eisen in een juridisch geschil. Een voordeel van de aantekening is, dat de licentiegever niet zelfstandig de registratie kan doorhalen. Een verzoek tot doorhaling van de licentie moet namelijk door beide partijen getekend worden. Het aantekenen van de licentie bindt partijen dan ook meer (wat een voordeel kan zijn voor de licentienemer).
In veel landen buiten de Benelux (zoals Oost Europese landen, Latijns Amerikaanse landen etc) moet de gebruiker van het merk dezelfde zijn als de houder van het merk. Als dit niet het geval is en het merk langer dan 5 jaar is geregistreerd kan het merk soms worden doorgehaald vanwege geen rechtmatig gebruik door de geregistreerde houder. Het aantekenen van een licentiehouder in het merkenregister is dan de enige mogelijkheid om de volledige rechten in stand te behouden.